Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HmgcrQ01237 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HmgcrQ01237 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms