Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrcdQ00LT2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrcdQ00LT2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms