Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp1Q00915 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp1Q00915 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms