Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabpb1Q00420 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Gabpb1Q00420 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms