Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp11aP98197 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp11aP98197 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms