Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp9bP98195 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp9bP98195 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp9bP98195 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms