Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfcP97953 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfcP97953 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VegfcP97953 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfcP97953 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfcP97953 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfcP97953 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfcP97953 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfcP97953 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VegfcP97953 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms