Protein–RNA interactions for Protein: P97494

Gclc, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclcP97494 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GclcP97494 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GclcP97494 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GclcP97494 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GclcP97494 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GclcP97494 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GclcP97494 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GclcP97494 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GclcP97494 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GclcP97494 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GclcP97494 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GclcP97494 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GclcP97494 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GclcP97494 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GclcP97494 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GclcP97494 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GclcP97494 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GclcP97494 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GclcP97494 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GclcP97494 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GclcP97494 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GclcP97494 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GclcP97494 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GclcP97494 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GclcP97494 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GclcP97494 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GclcP97494 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GclcP97494 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GclcP97494 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GclcP97494 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GclcP97494 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GclcP97494 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GclcP97494 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GclcP97494 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GclcP97494 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GclcP97494 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GclcP97494 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GclcP97494 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GclcP97494 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GclcP97494 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GclcP97494 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GclcP97494 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GclcP97494 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GclcP97494 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GclcP97494 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GclcP97494 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GclcP97494 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GclcP97494 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GclcP97494 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GclcP97494 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GclcP97494 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GclcP97494 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GclcP97494 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GclcP97494 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GclcP97494 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GclcP97494 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GclcP97494 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GclcP97494 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GclcP97494 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GclcP97494 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GclcP97494 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GclcP97494 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GclcP97494 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GclcP97494 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GclcP97494 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GclcP97494 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GclcP97494 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GclcP97494 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GclcP97494 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GclcP97494 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GclcP97494 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GclcP97494 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GclcP97494 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GclcP97494 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GclcP97494 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GclcP97494 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GclcP97494 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GclcP97494 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GclcP97494 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GclcP97494 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GclcP97494 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GclcP97494 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GclcP97494 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GclcP97494 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GclcP97494 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GclcP97494 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GclcP97494 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GclcP97494 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GclcP97494 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GclcP97494 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GclcP97494 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GclcP97494 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GclcP97494 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GclcP97494 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GclcP97494 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GclcP97494 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GclcP97494 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GclcP97494 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GclcP97494 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GclcP97494 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms