Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Crmp1P97427 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Crmp1P97427 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Crmp1P97427 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Crmp1P97427 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Crmp1P97427 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Crmp1P97427 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Crmp1P97427 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Crmp1P97427 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Crmp1P97427 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crmp1P97427 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crmp1P97427 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms