Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim43bP86448 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim43bP86448 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms