Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vgll3P85442 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vgll3P85442 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms