Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irx3P81067 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irx3P81067 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx3P81067 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx3P81067 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx3P81067 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx3P81067 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx3P81067 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx3P81067 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx3P81067 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Irx3P81067 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irx3P81067 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms