Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx2P81066 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx2P81066 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx2P81066 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx2P81066 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx2P81066 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx2P81066 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx2P81066 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx2P81066 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx2P81066 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms