Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptprn2P80560 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ptprn2P80560 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptprn2P80560 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptprn2P80560 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms