Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx2P80206 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx2P80206 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx2P80206 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx2P80206 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx2P80206 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Otx2P80206 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Otx2P80206 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Otx2P80206 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Otx2P80206 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx2P80206 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx2P80206 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx2P80206 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otx2P80206 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms