Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjb6P70689 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb6P70689 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms