Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sparcl1P70663 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sparcl1P70663 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.9 ms