Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53bp1P70399 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tp53bp1P70399 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms