Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad50P70388 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad50P70388 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad50P70388 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad50P70388 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad50P70388 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad50P70388 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad50P70388 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad50P70388 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rad50P70388 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rad50P70388 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms