Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cux2P70298 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cux2P70298 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cux2P70298 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cux2P70298 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Cux2P70298 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cux2P70298 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Cux2P70298 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cux2P70298 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cux2P70298 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Cux2P70298 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cux2P70298 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cux2P70298 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cux2P70298 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cux2P70298 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cux2P70298 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cux2P70298 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cux2P70298 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cux2P70298 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cux2P70298 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cux2P70298 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cux2P70298 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cux2P70298 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cux2P70298 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms