Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aup1P70295 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aup1P70295 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aup1P70295 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aup1P70295 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Aup1P70295 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aup1P70295 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aup1P70295 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Aup1P70295 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aup1P70295 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Aup1P70295 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aup1P70295 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aup1P70295 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aup1P70295 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aup1P70295 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aup1P70295 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aup1P70295 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aup1P70295 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aup1P70295 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Aup1P70295 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Aup1P70295 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Aup1P70295 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aup1P70295 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aup1P70295 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Aup1P70295 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aup1P70295 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aup1P70295 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aup1P70295 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aup1P70295 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aup1P70295 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aup1P70295 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Aup1P70295 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aup1P70295 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aup1P70295 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Aup1P70295 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aup1P70295 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Aup1P70295 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms