Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chl1P70232 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chl1P70232 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chl1P70232 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chl1P70232 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chl1P70232 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chl1P70232 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Chl1P70232 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chl1P70232 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms