Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Plxna3P70208 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms