Protein–RNA interactions for Protein: P63330

Ppp2ca, Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2caP63330 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp2caP63330 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp2caP63330 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp2caP63330 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp2caP63330 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp2caP63330 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp2caP63330 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp2caP63330 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp2caP63330 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp2caP63330 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppp2caP63330 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppp2caP63330 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppp2caP63330 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms