Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb3P63080 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb3P63080 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabrb3P63080 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gabrb3P63080 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabrb3P63080 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabrb3P63080 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms