Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps27aP62983 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps27aP62983 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps27aP62983 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps27aP62983 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps27aP62983 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps27aP62983 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps27aP62983 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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