Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2lP62876 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2lP62876 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2lP62876 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2lP62876 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2lP62876 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2lP62876 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2lP62876 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2lP62876 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2lP62876 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2lP62876 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2lP62876 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2lP62876 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2lP62876 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2lP62876 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2lP62876 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2lP62876 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2lP62876 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Polr2lP62876 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2lP62876 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2lP62876 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2lP62876 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2lP62876 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2lP62876 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2lP62876 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2lP62876 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2lP62876 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2lP62876 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2lP62876 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2lP62876 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2lP62876 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2lP62876 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2lP62876 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2lP62876 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2lP62876 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2lP62876 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2lP62876 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2lP62876 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2lP62876 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2lP62876 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms