Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ElobP62869 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ElobP62869 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ElobP62869 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ElobP62869 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ElobP62869 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ElobP62869 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ElobP62869 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ElobP62869 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ElobP62869 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ElobP62869 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ElobP62869 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ElobP62869 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ElobP62869 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ElobP62869 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ElobP62869 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ElobP62869 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ElobP62869 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ElobP62869 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ElobP62869 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ElobP62869 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ElobP62869 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ElobP62869 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ElobP62869 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ElobP62869 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ElobP62869 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ElobP62869 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ElobP62869 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ElobP62869 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ElobP62869 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ElobP62869 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ElobP62869 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ElobP62869 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ElobP62869 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ElobP62869 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ElobP62869 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ElobP62869 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ElobP62869 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ElobP62869 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ElobP62869 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ElobP62869 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ElobP62869 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ElobP62869 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ElobP62869 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ElobP62869 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ElobP62869 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ElobP62869 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ElobP62869 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ElobP62869 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ElobP62869 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ElobP62869 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ElobP62869 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ElobP62869 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ElobP62869 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ElobP62869 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ElobP62869 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ElobP62869 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ElobP62869 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ElobP62869 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ElobP62869 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ElobP62869 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ElobP62869 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ElobP62869 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ElobP62869 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ElobP62869 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ElobP62869 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElobP62869 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElobP62869 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElobP62869 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ElobP62869 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElobP62869 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElobP62869 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElobP62869 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElobP62869 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElobP62869 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElobP62869 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElobP62869 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElobP62869 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElobP62869 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElobP62869 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElobP62869 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElobP62869 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElobP62869 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms