Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vsnl1P62761 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vsnl1P62761 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vsnl1P62761 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms