Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo4P61969 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms