Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2kP61087 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ube2kP61087 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms