Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sem1P60897 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sem1P60897 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sem1P60897 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sem1P60897 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sem1P60897 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sem1P60897 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms