Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcbp1P60335 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcbp1P60335 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms