Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdo1P60334 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdo1P60334 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdo1P60334 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms