Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcmtd1P59913 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcmtd1P59913 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.8 ms