Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rin3P59729 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rin3P59729 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rin3P59729 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rin3P59729 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rin3P59729 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rin3P59729 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rin3P59729 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rin3P59729 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rin3P59729 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rin3P59729 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rin3P59729 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rin3P59729 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rin3P59729 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rin3P59729 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rin3P59729 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rin3P59729 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms