Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scarf2P59222 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Scarf2P59222 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms