Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fermt1P59113 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fermt1P59113 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fermt1P59113 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms