Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Csrnp3P59055 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Csrnp3P59055 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Csrnp3P59055 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms