Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp1P59054 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Csrnp1P59054 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Csrnp1P59054 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Csrnp1P59054 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Csrnp1P59054 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Csrnp1P59054 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Csrnp1P59054 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Csrnp1P59054 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Csrnp1P59054 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Csrnp1P59054 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Csrnp1P59054 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms