Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdrg1P59048 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdrg1P59048 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdrg1P59048 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms