Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps33bP59016 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps33bP59016 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms