Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uchl4P58321 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Uchl4P58321 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms