Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opa1P58281 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Opa1P58281 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa1P58281 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa1P58281 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Opa1P58281 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opa1P58281 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opa1P58281 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Opa1P58281 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opa1P58281 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opa1P58281 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opa1P58281 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Opa1P58281 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms