Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcstnP57716 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcstnP57716 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcstnP57716 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NcstnP57716 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NcstnP57716 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NcstnP57716 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NcstnP57716 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NcstnP57716 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NcstnP57716 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcstnP57716 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcstnP57716 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcstnP57716 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms