Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf5P56477 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irf5P56477 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irf5P56477 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irf5P56477 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irf5P56477 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf5P56477 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf5P56477 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms