Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms