Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GemP55041 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GemP55041 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GemP55041 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GemP55041 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GemP55041 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GemP55041 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GemP55041 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GemP55041 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GemP55041 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GemP55041 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GemP55041 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GemP55041 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GemP55041 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GemP55041 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GemP55041 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GemP55041 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GemP55041 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GemP55041 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GemP55041 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GemP55041 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GemP55041 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GemP55041 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GemP55041 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GemP55041 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GemP55041 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GemP55041 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GemP55041 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GemP55041 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GemP55041 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GemP55041 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GemP55041 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GemP55041 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GemP55041 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GemP55041 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GemP55041 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GemP55041 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GemP55041 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GemP55041 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GemP55041 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GemP55041 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GemP55041 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GemP55041 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GemP55041 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GemP55041 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GemP55041 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GemP55041 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GemP55041 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GemP55041 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GemP55041 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GemP55041 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GemP55041 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GemP55041 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GemP55041 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GemP55041 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GemP55041 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GemP55041 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GemP55041 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GemP55041 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GemP55041 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GemP55041 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GemP55041 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GemP55041 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GemP55041 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GemP55041 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GemP55041 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GemP55041 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GemP55041 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GemP55041 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GemP55041 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GemP55041 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GemP55041 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GemP55041 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GemP55041 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GemP55041 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GemP55041 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GemP55041 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GemP55041 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GemP55041 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GemP55041 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GemP55041 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GemP55041 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GemP55041 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GemP55041 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GemP55041 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GemP55041 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GemP55041 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GemP55041 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GemP55041 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GemP55041 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GemP55041 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GemP55041 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GemP55041 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GemP55041 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GemP55041 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GemP55041 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GemP55041 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GemP55041 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GemP55041 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GemP55041 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms