Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PklrP53657 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PklrP53657 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PklrP53657 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PklrP53657 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PklrP53657 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PklrP53657 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PklrP53657 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PklrP53657 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PklrP53657 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PklrP53657 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PklrP53657 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PklrP53657 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PklrP53657 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PklrP53657 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PklrP53657 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PklrP53657 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PklrP53657 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PklrP53657 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PklrP53657 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PklrP53657 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PklrP53657 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PklrP53657 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PklrP53657 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PklrP53657 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PklrP53657 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PklrP53657 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PklrP53657 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PklrP53657 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PklrP53657 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PklrP53657 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PklrP53657 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PklrP53657 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PklrP53657 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PklrP53657 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PklrP53657 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PklrP53657 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PklrP53657 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PklrP53657 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PklrP53657 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PklrP53657 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PklrP53657 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PklrP53657 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PklrP53657 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PklrP53657 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PklrP53657 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PklrP53657 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PklrP53657 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PklrP53657 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PklrP53657 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PklrP53657 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PklrP53657 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PklrP53657 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PklrP53657 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PklrP53657 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PklrP53657 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PklrP53657 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PklrP53657 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PklrP53657 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PklrP53657 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PklrP53657 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PklrP53657 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PklrP53657 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PklrP53657 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PklrP53657 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PklrP53657 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PklrP53657 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PklrP53657 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PklrP53657 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PklrP53657 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PklrP53657 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PklrP53657 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PklrP53657 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PklrP53657 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PklrP53657 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PklrP53657 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PklrP53657 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PklrP53657 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PklrP53657 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PklrP53657 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PklrP53657 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PklrP53657 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PklrP53657 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PklrP53657 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PklrP53657 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PklrP53657 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PklrP53657 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PklrP53657 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PklrP53657 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PklrP53657 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PklrP53657 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PklrP53657 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PklrP53657 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PklrP53657 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PklrP53657 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PklrP53657 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PklrP53657 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PklrP53657 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PklrP53657 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PklrP53657 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms