Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc1a1P51906 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc1a1P51906 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms